Tom 14, Nr 1 (2021)
Artykuł przeglądowy
Opublikowany online: 2021-03-31
Wyświetlenia strony
538
Wyświetlenia/pobrania artykułu
7818
Diagnostyka molekularna SARS-CoV-2
Journal of Transfusion Medicine 2021;14(1):1-9.
Streszczenie
Zakażenia nowym koronawirusem — SARS-CoV-2 — stały się w ostatnich miesiącach
głównym problemem epidemiologicznym oraz klinicznym na świecie, w tym Polsce w zakresie
chorób zakaźnych. Niniejszy artykuł powstał na podstawie wystąpienia zaprezentowanego
w trakcie webinaru zatytułowanego „Hematologia i transfuzjologia a COVID-19”, który odbył
się w maju 2020 roku. Praca ma na celu przybliżenie procedury diagnostyki zakażenia nowym
koronawirusem. Zwrócono w niej uwagę na krytyczne dla jakości wykonywanych badań
aspekty fazy przedanalitycznej oraz analitycznej, na które ma wpływ zarówno osoba zlecająca,
jak i personel wykonujący badanie. Na podstawie aktualnego piśmiennictwa przedstawiono
także dalsze kierunki doskonalenia diagnostyki molekularnej SARS-CoV-2.
Słowa kluczowe: SARS-CoV-2RT-PCRdiagnostyka
Referencje
- Zalecenia w COVID-19, wersja 1.0 – 23.04.2020, AOTMiT.
- „Zasady pobierania i transportu materiału do badań metodami molekularnymi rRT-PCR w kierunku SARS-CoV-2,” opracowane przez Konsultanta krajowego w dziedzinie mikrobiologii lekarskiej – Katarzynę Dzierżanowska-Fangrat oraz konsultantów wojewódzkich w dziedzinie mikrobiologii lekarskiej.
- Laboratory testing for 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) in suspected human cases. Interim guidance. 19 March 2020. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501.
- https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/need-extra-precautions/people-at-higher-risk.html.
- Sethuraman N, Jeremiah SS, Ryo A. Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2. JAMA. 2020; 323(22): 2249–2251.
- Gorzalski AJ, Tian H, Laverdure C, et al. High-Throughput Transcription-mediated amplification on the Hologic Panther is a highly sensitive method of detection for SARS-CoV-2. J Clin Virol. 2020; 129: 104501.
- Smith E, Zhen W, Manji R, et al. Analytical and Clinical Comparison of Three Nucleic Acid Amplification Tests for SARS-CoV-2 Detection. J Clin Microbiol. 2020; 58(9).
- Pham J, Meyer S, Nguyen C, et al. Performance Characteristics of a High-Throughput Automated Transcription-Mediated Amplification Test for SARS-CoV-2 Detection. J Clin Microbiol. 2020; 58(10).
- Broughton JP, Deng X, Yu G, et al. CRISPR-Cas12-based detection of SARS-CoV-2. Nat Biotechnol. 2020; 38(7): 870–874.
- Michel D, Danzer KM, Groß R, et al. Rapid, convenient and efficient kit-independent detection of SARS-CoV-2 RNA. J Virol Methods. 2020; 286: 113965.
- Chiara M, D'Erchia AM, Gissi C, et al. Next generation sequencing of SARS-CoV-2 genomes: challenges, applications and opportunities. Brief Bioinform. 2020 [Epub ahead of print].
- Wpis do wykazu laboratoriów COVID-19 Ministerstwa Zdrowia: laboratoriów (stan na 22 maja 2020 r.) /https://www.gov.pl/web/zdrowie/lista-laboratoriow-covid/.
- Rozporządzenie Rady Ministrów z dnia 16 maja 2020 r. w sprawie ustanowienia określonych ograniczeń, nakazów i zakazów w związku z wystąpieniem stanu epidemii Dziennik Ustaw 2020 r. poz. : 878.
- Instrukcja obsługi ARGENE®SARS-COV-2 R-GENE®[BIOMÉRIEUX Ref 423720, 055836 - 01 - 2020-04].
- https://gis.gov.pl/aktualnosci/definicja-przypadku-na-potrzeby-nadzoru-nad-zakazeniami-ludzi-nowym-koronawirusem-sars-cov-2/.
- https://www.finddx.org/covid-19/pipeline/.
- Abdalhamid B, Bilder CR, McCutchen EL, et al. Assessment of Specimen Pooling to Conserve SARS CoV-2 Testing Resources. Am J Clin Pathol. 2020; 153(6): 715–718.
- Zhen W, Manji R, Smith E, et al. Comparison of Four Molecular Diagnostic Assays for the Detection of SARS-CoV-2 in Nasopharyngeal Specimens. J Clin Microbiol. 2020; 58(8).
- Ishige T, Murata S, Taniguchi T, et al. Highly sensitive detection of SARS-CoV-2 RNA by multiplex rRT-PCR for molecular diagnosis of COVID-19 by clinical laboratories. Clin Chim Acta. 2020; 507: 139–142.
- Abdalhamid B, Bilder CR, McCutchen EL, et al. Assessment of Specimen Pooling to Conserve SARS CoV-2 Testing Resources. Am J Clin Pathol. 2020; 153(6): 715–718.
- Wacharapluesadee S, Kaewpom T, Ampoot W, et al. Evaluating the efficiency of specimen pooling for PCR-based detection of COVID-19. J Med Virol. 2020; 92(10): 2193–2199.
- Fomsgaard AS, Rosenstierne MW. An alternative workflow for molecular detection of SARS-CoV-2 - escape from the NA extraction kit-shortage, Copenhagen, Denmark, March 2020. Euro Surveill. 2020; 25(14).
