Tom 3, Nr 1 (2010)
Artykuł przeglądowy
Opublikowany online: 2010-03-19
Wyświetlenia strony
574
Wyświetlenia/pobrania artykułu
4039
Zastosowanie aparatu NucliSens easyMag do automatycznej izolacji kwasów nukleinowych w diagnostyce medycznej
Journal of Transfusion Medicine 2010;3(1):1-8.
Streszczenie
Automatyzacja laboratoriów wykorzystujących metody biologii molekularnej w diagnostyce
medycznej staje się obecnie coraz częściej koniecznością. W pracy przedstawiono informacje
dotyczące jednego z dostępnych na rynku urządzeń do automatycznej izolacji kwasów nukleinowych.
Omówiono podstawy procesów wykorzystanych w aparacie NucliSens easyMag (bio-
Merieux), charakterystykę urządzenia oraz przykłady jego zastosowania na podstawie własnych
doświadczeń i literatury. Przedstawiono zalety aparatu i problemy, z którymi mogą się
zetknąć użytkownicy tego typu urządzeń.
Zastosowanie omawianego ekstraktora w laboratorium diagnostycznym stanowi racjonalną alternatywę dla manualnych metod ekstrakcji kwasów nukleinowych; usprawnia rutynową pracę i stwarza nowe możliwości.
Zastosowanie omawianego ekstraktora w laboratorium diagnostycznym stanowi racjonalną alternatywę dla manualnych metod ekstrakcji kwasów nukleinowych; usprawnia rutynową pracę i stwarza nowe możliwości.
Słowa kluczowe: izolacja kwasów nukleinowychDNARNAautomatyzacjadiagnostyka medyczna
Referencje
- Boom R, Sol CJ, Salimans MM, et al. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. J Clin Microbiol. 1990; 28(3): 495–503.
- NucliSens EASYMAG Podręcznik użytkownika. Wersja 2.0 Holandia, 04.2008.
- Chan KH, Yam WC, Pang CM, et al. Comparison of the NucliSens easyMAG and Qiagen BioRobot 9604 nucleic acid extraction systems for detection of RNA and DNA respiratory viruses in nasopharyngeal aspirate samples. J Clin Microbiol. 2008; 46(7): 2195–2199.
- Kim S, Park SJ, Namgoong S, et al. Comparative evaluation of two automated systems for nucleic acid extraction of BK virus: NucliSens easyMAG versus BioRobot MDx. J Virol Methods. 2009; 162(1-2): 208–212.
- Dundas N, Leos NK, Mitui M, et al. Comparison of automated nucleic acid extraction methods with manual extraction. J Mol Diagn. 2008; 10(4): 311–316.
- Yera H, Filisetti D, Bastien P, et al. Multicenter comparative evaluation of five commercial methods for toxoplasma DNA extraction from amniotic fluid. J Clin Microbiol. 2009; 47(12): 3881–3886.
- Hantz S, Goudard M, Marczuk V, et al. [HPV detection and typing by INNO-LiPA assay on liquid cytology media Easyfix Labonord after extraction QIAamp DNA Blood Mini Kit Qiagen and Nuclisens easyMAG Biomérieux]. Pathol Biol (Paris). 2010; 58(2): 179–183.
- Perandin F, Pollara PC, Gargiulo F, et al. Performance evaluation of the automated NucliSens easyMAG nucleic acid extraction platform in comparison with QIAamp Mini kit from clinical specimens. Diagn Microbiol Infect Dis. 2009; 64(2): 158–165.
- Grabarczyk P, Brojer E, Nasiłowska B, et al. Użyteczność ilościowego badania techniką real-time PCR do wykrywania i monitorowania zakażenia cytomegalowirusem po przeszczepieniu allogenicznych komórek krwiotwórczych. Polski Merkuriusz Lekarski. 2006; 123: 227–231.
- Grabarczyk P. Wykrywanie i monitorowanie zakażeń CMV metodą ilościowego real-time PCR — nowe możliwości diagnostyki zakażenia wirusem CMV. Diagnostyka Laboratoryjna. 2008; 44: 249–260.
- Candotti D, Etiz N, Parsyan A, et al. Identification and characterization of persistent human erythrovirus infection in blood donor samples. J Virol. 2004; 78(22): 12169–12178.
- Machida U, Kami M, Fukui T, et al. Real-time automated PCR for early diagnosis and monitoring of cytomegalovirus infection after bone marrow transplantation. J Clin Microbiol. 2000; 38(7): 2536–2542.
- Łętowska M. Medyczne zasady pobierania krwi, oddzielania ich składników i wydawania, obowiązujące w jednostkach organizacyjnych publicznej służby krwi. Instytut Hematologii i Transfuzjologii, Warszawa 2009.
- Ginocchio CC, Manji R, Lotlikar M, et al. Clinical evaluation of NucliSENS magnetic extraction and NucliSENS analyte-specific reagents for real-time detection of human metapneumovirus in pediatric respiratory specimens. J Clin Microbiol. 2008; 46(4): 1274–1280.
- Scott LE, Noble LD, Moloi J, et al. Evaluation of the Abbott m2000 RealTime human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) assay for HIV load monitoring in South Africa compared to the Roche Cobas AmpliPrep-Cobas Amplicor, Roche Cobas AmpliPrep-Cobas TaqMan HIV-1, and BioMerieux NucliSENS EasyQ HIV-1 assays. J Clin Microbiol. 2009; 47(7): 2209–2217.
- Loens K, Bergs K, Ursi D, et al. Evaluation of NucliSens easyMAG for automated nucleic acid extraction from various clinical specimens. J Clin Microbiol. 2007; 45(2): 421–425.
- Béssède E, Renaudin H, Clerc M, et al. Evaluation of the combination of the NucliSENS easyMAG and the EasyQ applications for the detection of Mycoplasma pneumoniae and Chlamydia pneumoniae in respiratory tract specimens. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2010; 29(2): 187–190.
- Stevens W, Horsfield P, Scott LE. Evaluation of the performance of the automated NucliSENS easyMAG and EasyQ systems versus the Roche AmpliPrep-AMPLICOR combination for high-throughput monitoring of human immunodeficiency virus load. J Clin Microbiol. 2007; 45(4): 1244–1249.
- Koidl C, Bozic M, Hadzisejdic I, et al. Comparison of molecular assays for detection and typing of human papillomavirus. Am J Obstet Gynecol. 2008; 199(2): 144.e1–144.e6.
- Martró E, García-Sierra N, González V, et al. Evaluation of an automated nucleic acid extractor for hepatitis C virus load quantification. J Clin Microbiol. 2009; 47(3): 811–813.
- Caliendo AM, Ingersoll J, Fox-Canale AM, et al. Evaluation of real-time PCR laboratory-developed tests using analyte-specific reagents for cytomegalovirus quantification. J Clin Microbiol. 2007; 45(6): 1723–1727.
- Milia MG, Allice T, Gregori G, et al. Magnetic-silica based nucleic acid extraction for Human Immunodeficiency Virus Type-1 drug-resistance testing in low viremic patients. J Clin Virol. 2010; 47(1): 8–12.
- Pillet S, Bourlet T, Pozzetto B. Comparative evaluation of a commercially available automated system for extraction of viral DNA from whole blood: application to monitoring of epstein-barr virus and cytomegalovirus load. J Clin Microbiol. 2009; 47(11): 3753–3755.
- Manji R, Lotlikar M, Zhang F, et al. Clinical evaluation of NucliSENS magnetic extraction and NucliSENS analytical specific reagents for the real-time detection of respiratory syncytial virus (RSV) in paediatric respiratory specimens. J Clin Pathol. 2009; 62(11): 998–1002.
- Bose ME, Beck ET, Ledeboer N, et al. Rapid semiautomated subtyping of influenza virus species during the 2009 swine origin influenza A H1N1 virus epidemic in Milwaukee, Wisconsin. J Clin Microbiol. 2009; 47(9): 2779–2786.
- Bolotin S, De Lima C, Choi KW, et al. Validation of the TaqMan Influenza A Detection Kit and a rapid automated total nucleic acid extraction method to detect influenza A virus in nasopharyngeal specimens. Ann Clin Lab Sci. 2009; 39(2): 155–159.
- Stamper PD, Babiker W, Alcabasa R, et al. Evaluation of a new commercial TaqMan PCR assay for direct detection of the clostridium difficile toxin B gene in clinical stool specimens. J Clin Microbiol. 2009; 47(12): 3846–3850.
- Soetens O, Vauloup-Fellous C, Foulon I, et al. Evaluation of different cytomegalovirus (CMV) DNA PCR protocols for analysis of dried blood spots from consecutive cases of neonates with congenital CMV infections. J Clin Microbiol. 2008; 46(3): 943–946.
- Orzińska A, Guz K, Brojer E, et al. Preliminary results of fetal Rhc examination in plasma of pregnant women with anti-c. Prenat Diagn. 2008; 28(4): 335–337.
- Orzińska A, Engels K, Łakomy M, et al. Obecność „niemego” genu RHD u RhD ujemnej kobiety ciężarnej z przeciwciałami antyRhD uniemożliwia określenie genotypu RHD płodu metodą nieinwazyjną. Ginekol Pol. 2009; 80: 786–790.
- Orzińska A, Guz K, Brojer E. Nieinwazyjne badania prenatalne z osocza kobiet ciężarnych w konfliktach serologicznych w sce. Ginekol Pol. 2009; 80: 768–771.
- Lo YM, Corbetta N, Chamberlain PF, et al. Presence of fetal DNA in maternal plasma and serum. Lancet. 1997; 350(9076): 485–487.
