dostęp otwarty

Tom 8, Nr 3 (2006)
Opublikowany online: 2006-08-02
Pobierz cytowanie

Profile ekspresji genów apoptozy w miokardium chorych z zaawansowanym niedokrwieniem oraz po zawale serca, oceniane techniką mikromacierzy oligonukleotydowych

Józefa Dąbek, Zbigniew Gąsior, Przemysław Szmagała, Aleksander Owczarek, Andrzej Kułach, Barbara Monastyrska-Cup, Urszula Mazurek, Andrzej Bochenek
Chirurgia Polska 2006;8(3):184-190.

dostęp otwarty

Tom 8, Nr 3 (2006)
Opublikowany online: 2006-08-02

Streszczenie

Wstęp: Badania ostatnich lat dowodzą, że do śmierci kardiomiocytów w trakcie i po zawale serca może dochodzić zarówno w mechanizmie nekrozy, jak i apoptozy. Mimo że oba procesy prowadzą ostatecznie do niepożądanego efektu, udział apoptozy w tym zjawisku pociąga za sobą potencjalną możliwość wpływu przynajmniej na część populacji umierających komórek. Celem pracy była ocena metodą mikromacierzy oligonukleotydowych profilu ekspresji genów związanych z procesem apoptozy w miokardium chorych: z przebytym zawałem, z zaawansowaną chorobą wieńcową oraz u osoby bez choroby niedokrwiennej serca.
Materiał i metody: Analizie poddano uszka prawego przedsionka pochodzące od 3 chorych (po zawale serca, z przewlekłym niedokrwieniem oraz bez choroby niedokrwiennej serca), uzyskane w trakcie operacji kardiochirurgicznej w krążeniu pozaustrojowym. Po izolacji RNA z tkanki, za pomocą mikromacierzy Affymetrix HG_U133A, oceniano ekspresję 141 genów zaangażowanych w proces apoptozy. Podobieństwo transkryptomów chorych porównano metodą klasteryzacji hierarchicznej.
Wyniki: Na podstawie metody klasteryzacji hierarchicznej wykazano, iż profil ekspresji badanych genów w miokardium pacjenta po zawale serca różni się od transkryptomów pozostałych próbek. Na podstawie krzywej regresji wykazano, że transkryptami różnicującymi są geny CASP4, PDCD8, BBC3, BIT1 oraz DIABLO, wykazujące nadekspresję w próbce pozawałowej, oraz geny TNFRSF1A i TNFRSF21, wykazujące niższą ekspresję w miokardium pozawałowym w odniesieniu do klasteryzujących wspólnie pozostałych próbek.
Wnioski: Profil ekspresji genów związanych z apoptozą jest znamiennie różny w miokardium pozawałowym w porównaniu ze zdrową oraz przewlekle niedokrwioną mięśniówką serca. W badanym miokardium pozawałowym na uwagę zasługuje nadekspresja proapoptotycznych genów związanych z mitochondriami. Nie obserwowano natomiast istotnych różnic w ekspresji genów układu kaspaz, a 2 geny receptorów TNFα wykazały niższą ekspresję w tkance pochodzącej z serca pozawałowego.

Streszczenie

Wstęp: Badania ostatnich lat dowodzą, że do śmierci kardiomiocytów w trakcie i po zawale serca może dochodzić zarówno w mechanizmie nekrozy, jak i apoptozy. Mimo że oba procesy prowadzą ostatecznie do niepożądanego efektu, udział apoptozy w tym zjawisku pociąga za sobą potencjalną możliwość wpływu przynajmniej na część populacji umierających komórek. Celem pracy była ocena metodą mikromacierzy oligonukleotydowych profilu ekspresji genów związanych z procesem apoptozy w miokardium chorych: z przebytym zawałem, z zaawansowaną chorobą wieńcową oraz u osoby bez choroby niedokrwiennej serca.
Materiał i metody: Analizie poddano uszka prawego przedsionka pochodzące od 3 chorych (po zawale serca, z przewlekłym niedokrwieniem oraz bez choroby niedokrwiennej serca), uzyskane w trakcie operacji kardiochirurgicznej w krążeniu pozaustrojowym. Po izolacji RNA z tkanki, za pomocą mikromacierzy Affymetrix HG_U133A, oceniano ekspresję 141 genów zaangażowanych w proces apoptozy. Podobieństwo transkryptomów chorych porównano metodą klasteryzacji hierarchicznej.
Wyniki: Na podstawie metody klasteryzacji hierarchicznej wykazano, iż profil ekspresji badanych genów w miokardium pacjenta po zawale serca różni się od transkryptomów pozostałych próbek. Na podstawie krzywej regresji wykazano, że transkryptami różnicującymi są geny CASP4, PDCD8, BBC3, BIT1 oraz DIABLO, wykazujące nadekspresję w próbce pozawałowej, oraz geny TNFRSF1A i TNFRSF21, wykazujące niższą ekspresję w miokardium pozawałowym w odniesieniu do klasteryzujących wspólnie pozostałych próbek.
Wnioski: Profil ekspresji genów związanych z apoptozą jest znamiennie różny w miokardium pozawałowym w porównaniu ze zdrową oraz przewlekle niedokrwioną mięśniówką serca. W badanym miokardium pozawałowym na uwagę zasługuje nadekspresja proapoptotycznych genów związanych z mitochondriami. Nie obserwowano natomiast istotnych różnic w ekspresji genów układu kaspaz, a 2 geny receptorów TNFα wykazały niższą ekspresję w tkance pochodzącej z serca pozawałowego.
Pobierz cytowanie

Słowa kluczowe

mikromacierze oligonukleotydowe; apoptoza; zawał serca

Informacje o artykule
Tytuł

Profile ekspresji genów apoptozy w miokardium chorych z zaawansowanym niedokrwieniem oraz po zawale serca, oceniane techniką mikromacierzy oligonukleotydowych

Czasopismo

Chirurgia Polska

Numer

Tom 8, Nr 3 (2006)

Strony

184-190

Data publikacji on-line

2006-08-02

Rekord bibliograficzny

Chirurgia Polska 2006;8(3):184-190.

Słowa kluczowe

mikromacierze oligonukleotydowe
apoptoza
zawał serca

Autorzy

Józefa Dąbek
Zbigniew Gąsior
Przemysław Szmagała
Aleksander Owczarek
Andrzej Kułach
Barbara Monastyrska-Cup
Urszula Mazurek
Andrzej Bochenek

Ważne: serwis https://journals.viamedica.pl/ wykorzystuje pliki cookies. Więcej >>

Używamy informacji zapisanych za pomocą plików cookies m.in. w celach statystycznych, dostosowania serwisu do potrzeb użytkownika (np. język interfejsu) i do obsługi logowania użytkowników. W ustawieniach przeglądarki internetowej można zmienić opcje dotyczące cookies. Korzystanie z serwisu bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zapisane w pamięci komputera. Więcej informacji można znaleźć w naszej Polityce prywatności.

Czym są i do czego służą pliki cookie możesz dowiedzieć się na stronie wszystkoociasteczkach.pl.

Czasopismo Chirurgia Polska dostęne jest również w Ikamed - księgarnia medyczna

Wydawcą serwisu jest "VM Media sp. z o.o. VM Group sp.k., ul. Świętokrzyska 73, 80–180 Gdańsk

tel.:+48 58 320 94 94, faks:+48 58 320 94 60, e-mail: viamedica@viamedica.pl