dostęp otwarty
Profile ekspresji genów związanych z procesem włóknienia miocardium u chorych z zaawansowanym niedokrwieniem oraz po zawale serca oceniane techniką mikromacierzy oligonukleotydowych
dostęp otwarty
Streszczenie
Materiał i metody: Analizie poddano uszka prawego przedsionka pochodzące od 3 chorych uzyskane w trakcie operacji kardiochirurgicznej w krążeniu pozaustrojowym. Po izolacji RNA z tkanki, za pomocą mikromacierzy Affymetrix HG-U133A oceniano ekspresję 475 genów zaangażowanych w proces włóknienia. Podobieństwo transkryptomów chorych porównano metodą klasteryzacji hierarchicznej.
Wyniki i wnioski: Na podstawie metody klasteryzacji hierarchicznej wykazano, że profil ekspresji badanych genów w miokardium pacjenta po zawale różni się od transkryptomów pozostałych próbek. Dalsza analiza wykazała, że geny ENG, GSN, CTGF i NPPB wykazały nadekspresję, a gen SGK obniżoną ekspresję w próbce chorego po zawale w odniesieniu do klasteryzujących wspólnie pozostałych próbek.
Streszczenie
Materiał i metody: Analizie poddano uszka prawego przedsionka pochodzące od 3 chorych uzyskane w trakcie operacji kardiochirurgicznej w krążeniu pozaustrojowym. Po izolacji RNA z tkanki, za pomocą mikromacierzy Affymetrix HG-U133A oceniano ekspresję 475 genów zaangażowanych w proces włóknienia. Podobieństwo transkryptomów chorych porównano metodą klasteryzacji hierarchicznej.
Wyniki i wnioski: Na podstawie metody klasteryzacji hierarchicznej wykazano, że profil ekspresji badanych genów w miokardium pacjenta po zawale różni się od transkryptomów pozostałych próbek. Dalsza analiza wykazała, że geny ENG, GSN, CTGF i NPPB wykazały nadekspresję, a gen SGK obniżoną ekspresję w próbce chorego po zawale w odniesieniu do klasteryzujących wspólnie pozostałych próbek.
Słowa kluczowe
mikromacierze oligonukleotydowe; włóknienie; zawał serca
Tytuł
Profile ekspresji genów związanych z procesem włóknienia miocardium u chorych z zaawansowanym niedokrwieniem oraz po zawale serca oceniane techniką mikromacierzy oligonukleotydowych
Czasopismo
Numer
Strony
164-169
Opublikowany online
2009-05-06
Wyświetlenia strony
512
Wyświetlenia/pobrania artykułu
1719
Rekord bibliograficzny
Chirurgia Polska 2008;10(3-4):164-169.
Słowa kluczowe
mikromacierze oligonukleotydowe
włóknienie
zawał serca
Autorzy
Józefa Dąbek
Andrzej Bochenek
Andrzej Kułach
Joanna Orchel
Zbigniew Gąsior