Tom 9, Nr 4 (2017)
Artykuły
Opublikowany online: 2018-07-20
Wyświetlenia strony
1270
Wyświetlenia/pobrania artykułu
76
Możliwości diagnostyki laboratoryjnej w zakażeniach przewodu pokarmowego
Gastroenterologia Kliniczna 2017;9(4):106-113.
Streszczenie
Zakażenia przewodu pokarmowego są jedną z najczęściej występujących chorób u dzieci i osób dorosłych. Przyczyną mogą być czynniki bakteryjne, wirusowe czy pasożytnicze. Poznanie etiologii zakażenia i identyfikacja patogenu mają fundamentalne znaczenie dla podjęcia właściwego leczenia. Najlepszym rozwiązaniem diagnostyki zakażeń przewodu pokarmowego jest połączenie metod hodowlanych, serologicznych i molekularnych. Metody hodowlane znajdują zastosowanie głównie przy identyfikacji takich patogenów bakteryjnych, jak na przykład Salmonella, Shigella, Yersinia, Aeromonas, Plesiomonas czy Campylobacter. Metody serologiczne są przydatne szczególnie w identyfikacji zakażeń rotawirusami, adenowirusami, norowirusami oraz w niektórych zakażeniach bakteryjnych, między innymi Clostridium difficile. Metody molekularne umożliwiają wykrycie w próbkach materiału klinicznego obecności kwasów nukleinowych patogenów, których często nie udaje się wyizolować konwencjonalnymi metodami.
Słowa kluczowe: infekcjabakteriewirusypasożyty
Referencje
- Górska S. Jarząb A. Gamian A. Bakterie probiotyczne w przewodzie pokarmowym człowieka jako czynnik stymulujący układ odpornościowy Post. Hig Med Doś. 2009; 63: 653–667.
- Krakowiak O. Nowak R. Mikroflora przewodu pokarmowego człowieka - znaczenie rozwój modyfikacje. Post Fitot. 2015; 3: 193–200.
- Jarząb A, Górska-Frączek S, Rybka J, et al. Enterobacteriaceae infection – diagnosis, antibiotic resistance and prevention. Postępy Higieny i Medycyny Doświadczalnej. 2011; 65: 55–72.
- Zaborowski P. Postępowanie w zakażeniach i zarażeniach układu trawiennego. Klinika Now. 2007; 14(9-10).
- Podsiadły E, Demkow U. Diagnostyka mikrobiologiczna, immunologiczna i molekularna najczęstszych zakażeń pokarmowy u dzieci. Med Prak Pediat. 2018; 1: 105–121.
- Szych J., Rekomendacje laboratoryjnej diagnostyki zakażeń przewodu pokarmowego bakteriami rosnącymi w warunkach tlenowych oraz mikroaerofilnych. www.kidl.org.pl/rekomendacje.
- Shane AL, Mody RK, Crump JA, et al. 2017 Infectious Diseases Society of America Clinical Practice Guidelines for the Diagnosis and Management of Infectious Diarrhea. Clin Infect Dis. 2017; 65(12): e45–e80.
- Ravikumara M. Investigation of chronic diarrhoea. Paediatrics and Child Health. 2008; 18(10): 441–447.
- White AC, Kang G. Multiplex molecular diagnostic tests and the management of diarrhea: the wave of the future? Curr Opin Infect Dis. 2017; 30(5): 471–472.
- Kosikowska U, Stępień-Pyśniak D, Pietras-Ożga D. Zastosowanie spektrometrii masowej MALDI-TOF MS w identyfikacji bakterii izolowanych z materiałów klinicznych od ludzi i zwierząt . Diagn. Lab. 2015; 51(1): 23–30.
- Azarko J. Wendt U. Identyfikacja drobnoustrojów – porównanie metody biochemicznej i spektrometrii masowej Diagn. Lab. 2011; 47(4): 409–417.
- Mielczarek P. Bałgaj M. Jersinioza-rzadko rozpoznawana choroba układu pokarmowego. Gastro Pol. 2004; 11(1): 69–74.
- Rokosz N, Rastawicki W, Wołkowicz T. Microbiological diagnosis of infections caused by Campylobacter jejuni and Campylobacter coli in humans. Postępy Higieny i Medycyny Doświadczalnej. 2014; 68: 48–56.
- Szczepańska B. Andrzejewska M. Śpica D. Klawe J. Campylobacter spp. - niedoceniony w Polsce czynnik etiologiczny zakażeń przewodu pokarmowego Probl. Hig Epidemiol. 2014; 95(3): 574–579.
- Rovida F, Campanini G, Sarasini A, et al. Comparison of immunologic and molecular assays for the diagnosis of gastrointestinal viral infections. Diagn Microbiol Infect Dis. 2013; 75(1): 110–111.
- Feeney SA, Armstrong VJ, Mitchell SJ, et al. Development and clinical validation of multiplex TaqMan® assays for rapid diagnosis of viral gastroenteritis. J Med Virol. 2011; 83(9): 1650–1656.
- Baron EJo, Miller JM, Weinstein MP, et al. A guide to utilization of the microbiology laboratory for diagnosis of infectious diseases: 2013 recommendations by the Infectious Diseases Society of America (IDSA) and the American Society for Microbiology (ASM)(a). Clin Infect Dis. 2013; 57(4): e22–e2e121.
- Crobach M, Planche T, Eckert C, et al. European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases: update of the diagnostic guidance document for Clostridium difficile infection. Clinical Microbiology and Infection. 2016; 22: S63–S81.
- Planche T, Davies K, Coen P, et al. Differences in outcome according to Clostridium difficile testing method: a prospective multicentre diagnostic validation study of C difficile infection. The Lancet Infectious Diseases. 2013; 13(11): 936–945.
- Martirosian G. Zakażenia Clostridium difficile – aktualny punkt widzenia . Aktualności Narodowego Programu Ochrony Antybiotyków. 2015(4).
- Rokosz N, Rastawicki W, Jagielski M, et al. Wykrywanie przeciwciał dla pałeczek Campylobacter jejuni u dzieci z zespołem Guillain-Barré przy zastosowaniu różnych preparatów antygenowych. Med Dośw Mikrobiol. 2011; 63: 255–261.
- Rastawicki W. Humoralna odpowiedź na wybrane antygeny pałeczek Yersinia enterocolitica i Yersinia pseudotuberculosis w przebiegu jersiniozy u ludzi. I. Występowanie i poziom przeciwciał dla somatycznych antygenów pałeczek Yersinia oraz wydzielniczych białek Yop wykrytych odczynem ELISA. Med. Dośw Mikrobiol. 2006; 58: 303–328.
- Korzeniowski K. Choroby pasożytnicze przewodu pokarmowego w Polsce. Forum Medycyny Rodzinnej . 2016; 10(1): 10–18.
- Binnicker MJ. Multiplex Molecular Panels for Diagnosis of Gastrointestinal Infection: Performance, Result Interpretation, and Cost-Effectiveness. J Clin Microbiol. 2015; 53(12): 3723–3728.
- Platts-Mills JA, Operario DJ, Houpt ER. Molecular diagnosis of diarrhea: current status and future potential. Curr Infect Dis Rep. 2012; 14(1): 41–46.
- Zhang H, Morrison S, Tang YW. Multiplex polymerase chain reaction tests for detection of pathogens associated with gastroenteritis. Clin Lab Med. 2015; 35(2): 461–486.
- Garg SK, Lu K, Duncan J, et al. Equivalent Performance of the Cobas Cdiff Test for Use on the Cobas Liat System and the Cobas 4800 System. Eur J Microbiol Immunol (Bp). 2017; 7(4): 310–318.
- Piralla A, Lunghi G, Ardissino G, et al. FilmArray™ GI panel performance for the diagnosis of acute gastroenteritis or hemorragic diarrhea. BMC Microbiol. 2017; 17(1): 111.
