Uruchomienie laboratorium diagnostycznego COVID-19 w szpitalu onkologicznym – przegląd wytycznych oraz doświadczenia własne
Streszczenie
Pierwszy przypadek zakażenia koronawirusem SARS-CoV-2 został potwierdzony w grudniu 2019 roku w mieście Wuhan w Chinach, skąd w ciągu kilku tygodni wirus rozprzestrzenił się po całym świecie. W związku z alarmującym poziomem zakażeń Światowa Organizacja Zdrowia (World Health Organization – WHO) ogłosiła 11 marca pandemię SARS-CoV-2. Dynamiczna i bezprecedensowa sytuacja epidemiologiczna wywołała pilną potrzebę wykonywania badań w kierunku SARS-CoV-2 u osob spełniających kryteria przypadku z podejrzeniem COVID-19. Według obecnych zaleceń WHO podstawą rozpoznania aktywnego zakażenia SARS-CoV-2 jest diagnostyka molekularna z zastosowaniem reakcji łańcuchowej polimerazy z odwrotną transkrypcją w czasie rzeczywistym (real-time reverse transcription, real time – RT-PCR). Metoda ta jest wysoce specyficzna i czuła, i pozwala na wykrycie w badanej probce nawet niewielkiej liczby cząsteczek RNA wirusa. Niewątpliwie uruchamianie laboratoriow COVID oraz wdrażanie odpowiednich procedur postępowania ma na celu zwiększenie skuteczności działań w obszarze bezpośredniej walki z pandemią SARS-CoV-2. Populacją szczegolnie narażoną na wystąpienie powikłań i zgonu w wyniku zakażenia koronawirusem są pacjenci onkologiczni, dlatego w szpitalach onkologicznych kluczowe jest zapewnienie możliwości szybkiego testowania w kierunku COVID-19. W niniejszej pracy przedstawiono własne doświadczenia oraz merytoryczne i formalne zagadnienia związane z utworzeniem laboratorium do wykrywania zakażenia SARS-CoV-2.
Słowa kluczowe: COVID-19SARS-CoV-2diagnostykareal-time RT-PCR
Referencje
- Laboratory testing for coronavirus disease 2019 (COVID-19) in suspected human cases. Interim guidance, 2 March 2020, WHO.
- Laboratory biosafety guidance related to coronavirus disease 2019 (COVID-19) Interim guidance, 12 February 2020, WHO.
- Katarzyna Dzierżanowska-Fangrat, Konsultant krajowy w dziedzinie mikrobiologii lekarskiej, Zasady pobierania i transportu materiału do badań metodami molekularnymi RT PCR w kierunku SARS-CoV-2, aktualizacja 14.04.2020. https://kidl.org.pl/get-file/2671 (13.05.2020).
- Rekomendacje NIZP-PZH w zakresie diagnostyki molekularnej SARS-CoV-2 Warszawa 24.04.2020. https://www.pzh.gov.pl/wp-content/uploads/2020/04/Rekomendacje-w-zakresie-diagnostyki-molekularnej-SARS-CoV-2.pdf (13.05.2020).
- Rekomendacje NIZP-PZH: Wymagania dotyczące pobrania i transportu materiału do badań metodą RT-PCR w kierunku zakażeń układu oddechowego powodowanych przez koronawirusy (SARS; MERS; SARS-CoV-2 – COVID-19). Warszawa 29.02.2020. https://www.pzh.gov.pl/wp-content/uploads/2020/02/Wymagania-dotycz%C4%85ce-materia%C5%82u-do-bada%C5%84-COVID-19-29.02.2020.pdf (13.05.2020).
- CDC Interim Guidelines for Collecting, Handling, and Testing Clinical Specimens from Persons for Coronavirus Disease 2019 (COVID-19).
- Zalecenia i rekomendacje Polskiego Towarzystwa Onkologicznego dla pacjentów onkologicznych w związku z epidemią wirusa SARS-CoV-2 08.042020.
- Leczenie systemowe pacjentów z rozpoznaniem choroby nowotworowej w kontekście pandemii SARS-CoV-2 — stanowisko Polskiego Towarzystwa Onkologii Klinicznej 20.03.2020.
- Guan WJ, Ni ZY, Hu Yu, et al. China Medical Treatment Expert Group for Covid-19. Clinical Characteristics of Coronavirus Disease 2019 in China. N Engl J Med. 2020; 382(18): 1708–1720.
- Wojciechowska U, Didkowska J. Zachorowania i zgony na nowotwory złośliwe w Polsce. Krajowy Rejestr Nowotworów, Narodowy Instytut Onkologii im. Marii Skłodowskiej-Curie – Państwowy Instytut Badawczy. http://onkologia.org.pl/raporty/ (13.05.2020).
- Matheeussen V, Corman VM, Donoso Mantke O, et al. RECOVER project and collaborating networks. International external quality assessment for SARS-CoV-2 molecular detection and survey on clinical laboratory preparedness during the COVID-19 pandemic, April/May 2020. Euro Surveill. 2020; 25(27).
- Rekomendacje dotyczące walidacji badań molekularnych w kierunku SARS-CoV2 w sieci laboratoriów COVID, Ministerstwo Zdrowia 21.04.2020.
