Związek między bólami głowy i snem stanowił przedmiot zainteresowania wielu badaczy. Przez wiele lat sen był jedną ze skutecznych metod przerywania bólu w przebiegu migreny. Wzajemne powiązania między snem i bólami głowy wydają się skomplikowane i obustronne. Zarówno sen wpływa na występowanie bólów głowy, jak i bóle głowy pogarszają jakość snu. W badaniach opisuje się częstsze występowanie zaburzeń snu u dzieci z bólami głowy; dotyczy to występowania parasomnii, trudności w zasypianiu, częstych nocnych wybudzeń i nadmiernej senności w ciągu dnia. U dzieci z bólami głowy obserwowano również zwiększoną fragmentację snu nocnego — zarówno u dzieci z migreną, jak i bólami głowy typu napięciowego. Problemy ze snem, poprzez mechanizm częściowej deprywacji snu, mogą powodować zwiększenie częstości występowania epizodów bólowych u pacjentów z bólami głowy. Leczenie zaburzeń snu u dzieci z przewlekłymi bólami głowy może powodować zmniejszenie częstotliwości epizodów bólowych. Zaobserwowano również pozytywny wpływ edukacji zdrowotnej w zakresie higieny snu u dzieci z przewlekłymi bólami głowy, szczególnie w przypadku migreny. Uważa się, że wśród dzieci z bólami głowy obserwuje się gorsze przestrzeganie zasad higieny snu niż w populacji ogólnej. Badania dowodzą, że u dzieci, które dostosowały się do zasad higieny snu, obserwowano zmniejszenie częstotliwości epizodów bólowych w przebiegu migreny. Poznanie anatomicznych i fizjologicznych podstaw obu grup problemów pozwoli na wdrożenie skuteczniejszych metod terapeutycznych, szczególnie u dzieci i młodzieży.