Vol 4, Supp. D (2008)
Other materials agreed with the Editors
Published online: 2009-04-20
Polimorfizm genów i haplotypów głównego kompleksu zgodności tkankowej (MHC) w chłoniakach nieziarniczych
Abstract
W opublikowanych wcześniej pracach wykazano istotny wpływ genów głównego układu zgodności tkankowej
(MHC, major histocompatibility complex), takich jak geny czynnika martwicy nowotworów (TNF,
tumor necrosis factor) limfotoksyny alfa (LTA), genów kodujących antygeny leukocytów ludzkich (HLA)-
-DR2 oraz haplotypu A1-B8-TNF-308A na przebieg kliniczny chłoniaków nieziarniczych (ChN). W przedstawionej
pracy określono polimorfizm alleli HLA-A, Cw, B i DRB1 oraz polimorfizm pojedynczych nukleotydów
(SNPs, single nucleotide polymorphisms) nienależących do HLA genów LTA+252 i TNF-308 u 154 pacjentów
pochodzenia europejskiego z Francji oraz w etnicznie zgodnej grupie kontrolnej złożonej
ze 120 zdrowych osób. U badanych pacjentów określono również najbardziej prawdopodobne pary haplotypów,
złożone z 6 wymienionych wyżej loci genowych zlokalizowanych blisko siebie w obrębie MHC,
a ich fragmenty poddano analizie wpływu na wartość parametrów klinicznych i laboratoryjnych. U pacjentów
z ChN wykazano istotnie zwiększoną częstość allelu HLA-Cw*04, a także istotnie obniżoną częstość
A*31, B*53, *57, Cw*03, *06, *07, DRB1*04 i *13 sugerującą ochronną rolę tych alleli w zachorowaniu
na ChN. Jednocześnie w modelu regresji F proporcjonalnego hazardu Coksa wykazano skrócenie czasu
przeżycia wolnego od choroby (FFP, freedom from progression) i/lub całkowitego przeżycia (OS, overall
survival) u pacjentów z ChN posiadających A*32, *68, Cw*16, DRB1*01, *09 lub *14 oraz istotnie przedłużony
czas FFP i OS u nosicieli alleli A*02, B*07, Cw*05 i DRB1*11. W grupie pacjentów z ChN wykazano
istnienie 10 szerokich konserwatywnych haplotypów MHC (AH, ancestral haplotypes) o częstości powyżej
1%. Metodą mapowania szerokich haplotypów i ich fragmentów wykazano, że jedynym fragmentem
złożonym z dwóch sąsiednich loci, należącym do szerokiego haplotypu 8.1 AH, wykazującym negatywny
wpływ na FFP był fragment B*08-LTA+252G (p = 0,0084; RR = 2,45). Fragment tego haplotypu
o długości 305 kbp złożony z alleli 4 loci Cw*07-B*08-LTA+252G-TNF-308A był znacznie silniej związany ze
skróconym FFP (p = 0,00045, RR = 3,26). Analiza bloków haplotypowych należących do 8.1AH złożonych
z 5 i 6 loci wykazała słabszą asocjację z przebiegiem klinicznym ChN, co świadczy o wpływie nierównowagi
sprzężeń (LD, linkage disequilibrium) na asocjacje pozostałych alleli należących do 8.1AH
(A*01 oraz DRB1*03). Wszystkie analizowane fragmenty haplotypu 7.1AH wpływały korzystnie na przebieg
ChN, a fragmentem o najwyższej asocjacji był allel TNF-308G. Bloki haplotypowe A*11-Cw*04 oraz
TNF-308G-DRB1*01 należące do haplotypu 35.1AH posiadały również istotną wartość predykcyjną niekorzystnego
przebiegu klinicznego ChN. Analiza wieloczynnikowa wykazała, że bloki haplotypowe Cw*07-
B*08-LTA+252G-TNF-308A oraz TNF-308G-DRB1*01 posiadają niezależną wartość predykcyjną dla skróconego
FFP (p = 0,024 i p = 0,027) i jest ona niezależna od międzynarodowego wskaźnika prognostycznego
(p = 0,00044). Wykazano również, że niedobór alleli HLA klasy I posiadających zdolność ligacji KIR należących do grupy Bw4 i C1, a także obecność alleli HLA DRB1*01, *07 i *09 wpływa negatywnie na
przebieg kliniczny ChN. Sugeruje to, że istotnym obciążającym czynnikiem rokowniczym ChN jest ograniczony
repertuar ligandów KIR i niedobór prezentacji peptydów w kontekście cząsteczek MHC. Dokładne
położenie genów wrażliwości w obrębie asocjujących bloków haplotypowych należy wyznaczyć w przyszłości
przy użyciu precyzyjnego mapowania genetycznego za pomocą badań mikrosatelitów i SNP o wysokiej
gęstości. Analiza polimorfizmu MHC pozwala na wykazanie podwyższonego ryzyka zachorowania na ChN,
dokładniejsze określenie rokowania klinicznego przebiegu choroby oraz ukierunkowanie badań nad nowymi
metodami leczenia ChN.
Keywords: allele HLAasocjacjeligandy KIRhaplotypy MHCchłoniaki nieziarniczenierównowaga sprzężeńrokowanie